Rapat awal tahun pelajara 2012-2013 MISS Proto 01 kec kedungwuni. kab. pekalongan. pada hari ahad 15 juli 2012 dihadiri para wali murid, komite, dan pengurus Yayasan YPISS Proto. Pengelolan Madrasah lain dari pengelolaan lolan sekolah atau madrasah negeri, madrasah yayasan merupakan tumbuh dan dirawat oleh Masyarakat pendanaan menjadi kesadaran masyarakat pecinta madrasah karena madrasah menjadi harapan pembentuk moral bagi generasi penerus bangsa yang berakhlakul karimahh.
Selain menjadi tulang punggung madrasah, infaq memiliki fungsi untuk mensucikan hati anak-anak peserta didik untuk membentuk pribadi anak sholeh-sholehah hal ini disampaikan oleh ketua Yayasan Pendidikan Islam Salafiyah Syafi'yah Proto KH Drs. Abdul Basit Al-Hafidz.dalam pengarahannya.
Walimurid mendukung penuh kebijakan Yayasan.dengan mendaftar sebagai aghniya/ donatur dengan nilai berfariasi sesuai kesanggupan wakimurid. Siswa miskin masih menjadi perhatian utama dengan diberi kebebasan .